研究所面向湖泊-流域系统科学前沿、国家重大战略及地方湖泊治理需求，“十四五”期间，持续深耕湖泊生态系统演化与评估、湖库水环境治理与安全保障、流域地理与绿色发展等三大主攻方向，着力建设国际一流科研机构并取得阶段性成果，近70%指标达到与国际一流科研机构建设水平。

    领军科学家队伍与人才梯队建设富有成效。自主培养国家自然科学基金青年A类人才6人、青年B类人才4人、国家高层次人才特殊支持计划2人，形成高层次人才引领下的多学科均衡发展格局。引进院高水平人才1名，备案11名，国内外优秀人才集聚效应初显。全所45周岁以下青年科研人员占比73%，人才梯队合理、发展潜力巨大。现有国家自然科学基金A类人才10人，占国内湖沼学研究领域同类人才数量的64%。秦伯强、张运林、施坤、段洪涛等4位科学家在湖沼学SCI期刊发文量位居全球前10；张恩楼、吴庆龙、宋春桥、周永强等8位科学家发文量位居全球前100。

    重大科技平台建设有力支撑学科体系发展。获批建设湖泊与流域水安全全国重点实验室，形成全国唯一以湖泊–流域系统为核心研究对象的集群创新中心。依托我所野外站布局优势，倡导成立了长江流域野外站联合观测联盟，推动湖泊流域及生态观测数据互联共享。湖库野外站数量在科研院校占比30%，太湖湖泊生态系统国家野外站连续三次评估优秀、鄱阳湖湖泊湿地生态系统国家野外站入围优秀站答辩、湖泊–流域科学数据中心连续两年获国家科技基础条件平台中心考核优秀。重大科技平台支撑学科建设取得显著成效，“十四五”期间全球前1%学科包括环境学及生态学、地学、工程学、植物与动物科学、社会科学，较“十三五”期间增加1个。

    基础研究成果引领一流科研机构建设加速推进。在PNAS、Nature及Science子刊、国内高水平期刊发表论文41篇，原创性系统性引领性成果呈暴发态势，高被引论文增至61篇，4位科学家连续入选全球高被引学者榜单，相关成果入选行业年度十大科技进展、Nature亮点成果。五年来，发表湖泊主题SCI期刊论文1496篇（每年稳定300篇左右），占全院同主题发文量的22%，H指数位列美国内政部体系、德国亥姆霍兹联合会等8家国际机构（发文量均呈下降趋势）首位。发表湖泊流域主题CSCD期刊论文338篇，数量居全国首位，发文量为排名第二的河海大学和排名第三的中国环境科学研究院的2倍以上。相关成果获得省部级科技奖励17项。

    湖库水安全保障能力稳步提升。在水科学领域Nature Index期刊发表湖泊主题论文132篇，占全球同期发文量的17.6%，为湖库水安全保障技术、装备、平台研发奠定基础。围绕湖泊流域水环境多要素感知、蓝藻水华监测预警与高效处置、水生生态系统退化与生态修复等难题，申请并授权发明专利197项，含国际发明专利4项。原创高光谱近感技术与监测设备，并在全国50余个河湖水体实现产业化应用，产品联合海康威视销售额超4亿元，成果入选2024年度院信息化年报、2025年度生态环境科技成果转化典型案例。数字巢湖、太湖、千岛湖等平台通过融合AI技术不断迭代更新，实现藻华次日预报精度优于85%，累计发布藻华监测预警报告4000余期。

    高端智库服务决策水平不断提高。发布了《中国湖泊生态环境研究报告》《长江经济带高质量发展评估研究报告》，推动我国五大湖区湖泊治理与生态修复、长江经济带高质量发展。五年来，围绕湖泊流域水安全保障、重要湖库治理修复、长江大保护等国家需求，提交咨询报告90份，其中22份获中央有关部门采纳，2023–2024年连续获评院政务信息工作先进单位。牵头编制《水生态健康评价技术指南（GB/T 43476-2023）》《南京都市圈发展规划》《太湖湖体及一级保护区生态修复与保护规划（2025–2035年）》等重要标准规划，共同主编《长江三角洲区域生态环境共同保护规划》，天目湖流域示范区入选国家发改委“建立健全生态产品价值实现”经典案例和生态环境部生态补偿典型案例。

    国内国际综合影响力持续扩大。着力打造了“全国湖泊论坛”和“长江经济带高质量发展论坛”两大学术品牌。与联合国环境规划署、粮农组织等国际组织建立合作关系，并推荐科研骨干在国际湖沼学会、全球湖泊生态观测网络等机构任职。深化与欧美及“一带一路”沿线国家的合作，牵头承担PIFI国际杰出团队项目，建成中坦水环境保护与水生资源管理联合实验室。组织“一带一路”沿线10余国开展互访交流，并牵头对贝加尔湖、东非及中亚湖泊开展联合科考，为全球湖泊治理贡献中国智慧。